Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CARMIL2Q6F5E8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL2Q6F5E8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms