Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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RAB3GAP1Q15042 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3GAP1Q15042 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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RAB3GAP1Q15042 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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RAB3GAP1Q15042 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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