Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCBP1Q09161 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms