Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms