Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms