Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms