Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EFNA4P52798 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms