Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DUSP1P28562 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms