Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms