Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BMP4P12644 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BMP4P12644 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BMP4P12644 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BMP4P12644 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
BMP4P12644 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BMP4P12644 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms