Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms