Protein–RNA interactions for Protein: F6QL70

Gm17669, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17669F6QL70 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17669F6QL70 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms