Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A8MVJ9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms