Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPDC1A2A3K4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms