Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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HECTD4Q9Y4D8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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HECTD4Q9Y4D8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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HECTD4Q9Y4D8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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HECTD4Q9Y4D8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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HECTD4Q9Y4D8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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HECTD4Q9Y4D8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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HECTD4Q9Y4D8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HECTD4Q9Y4D8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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