Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
L1RE1Q9UN81 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms