Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMGXB4Q9UGU5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms