Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms