Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms