Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM8Q9BZR9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms