Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD8Q96LT4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms