Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms