Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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