Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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GPS1Q13098 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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