Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms