Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVFRD-1P60508 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms