Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA10O75578 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms