Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHF1O43189 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHF1O43189 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF1O43189 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF1O43189 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF1O43189 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF1O43189 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF1O43189 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF1O43189 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHF1O43189 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHF1O43189 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHF1O43189 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms