Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF22A3QJZ6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF22A3QJZ6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms