Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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