Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms