Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms