Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP4F12Q9HCS2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms