Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms