Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRG4Q92954 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms