Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRRC8EQ6NSJ5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms