Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms