Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms