Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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