Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms