Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHDQ02161 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHDQ02161 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHDQ02161 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RHDQ02161 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHDQ02161 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms