Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms