Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPD2P43304 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPD2P43304 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPD2P43304 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPD2P43304 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPD2P43304 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPD2P43304 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms