Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP2P42575 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP2P42575 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP2P42575 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms