Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms