Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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HLA-DQB1P01920 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DQB1P01920 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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