Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms