Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD3A6NKT7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms