Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNPO3Q9Y5L0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms