Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms